Se revisaron, sintetizaron y compararon aspectos de la evolución de los genomas en las angiospermas. Las plantas con flores presentan tres genomas: el del cloroplasto, el de la mitocondria y el nuclear. El genoma del cloroplasto tiene una estructura muy conservada (120-217kb)que incluye 110-113 genes. El genoma de la mitocondria es mayor (300-600kb)y contiene cerca de 60 genes, es un genoma muy dinámico ya que gana y pierde fácilmente secuencias nucleares y del cloroplasto. Los genomas nucleares de las angiospermas se encuentran entre los más grandes conocidos. El genoma nuclear de Arabidopsis thaliana tiene 125Mb que comprenden 25498 genes. Del arroz (Oryza sativa)se han secuenciado dos variedades y su genoma es casi 4 veces más grande que el de A. thaliana y comprenden de 32000 a 55615 genes. Para el maíz (Zea mays), aunque no secuenciado, se tiene mucha información y se estima que 60 a 80 porciento de su genoma nuclear está constituido por elementos móviles. Las substituciones sinónimas de los genes de cloroplasto son de 2 a 3 veces más rápidas que en las mitocondrias, y los genes nucleares cambian de 10 a 15 veces más rápido que los mitocondriales. Sin embargo, las tasas de substitución de los sitios no sinónimos son similares entre mitocondria y cloroplasto, y son un poco más altas en el núcleo. Los estudios detallados de estos tres genomas permiten avanzar en el entendimiento de las complejidades genéticas y evolutivas de este grupo de plantas.