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Full-length agave transcriptome reveals candidate glycosyltransferase genes involved in hemicellulose biosynthesis (Record no. 31773)

MARC details
000 -LEADER
campo de control de longitud fija 02579nam a2200325Ia 4500
003 - IDENTIFICADOR DE NÚMERO DE CONTROL
campo de control MX-MdCICY
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20260521091814.0
040 ## - FUENTE DE CATALOGACIÓN
Centro/agencia transcriptor CICY
090 ## - LOCALMENTE ASIGNADO TIPO-LC NÚMERO DE CLASIFICACIÓN (OCLC); NÚMERO DE CLASIFICACIÓN LOCAL (RLIN)
Número de clasificación (OCLC) (R) ; Numero de clasificación, CALL (RLIN) (NR) B-21772
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 250602s9999 xx |||||s2 |||| ||und|d
245 10 - MENCIÓN DEL TÍTULO
Título Full-length agave transcriptome reveals candidate glycosyltransferase genes involved in hemicellulose biosynthesis
490 0# - MENCIÓN DE SERIE
Mención de serie International Journal of Biological Macromolecules, 274, p.133508, 2024
500 ## - NOTA GENERAL
Nota general Artículo
520 3# - RESUMEN, ETC.
Sumario, etc. Agave species are typical crassulacean acid metabolism (CAM) plants commonly cultivated to produce beverages, fibers, and medicines. To date, few studies have examined hemicellulose biosynthesis in Agave H11648, which is the primary cultivar used for fiber production. We conducted PacBio sequencing to obtain full-length tran scriptome of five agave tissues: leaves, shoots, roots, flowers, and fruits. A total of 41,807 genes were generated, with a mean length of 2394 bp and an annotation rate of 97.12 percent using public databases. We identified 42 glycosyltransferase genes related to hemicellulose biosynthesis, including mixed-linkage glucan (1), gluco mannan (5), xyloglucan (16), and xylan (20). Their expression patterns were examined during leaf development and fungal infection, together with hemicellulose content. The results revealed four candidate glycosyl transferase genes involved in xyloglucan and xylan biosynthesis, including glucan synthase (CSLC), xylosyl transferase (XXT), xylan glucuronyltransferase (GUX), and xylan α-1,3-arabinosyltransferase (XAT). These genes can be potential targets for manipulating xyloglucan and xylan traits in agaves, and can also be used as candidate enzymatic tools for enzyme engineering. We have provided the first full-length transcriptome of agave, which will be a useful resource for gene identification and characterization in agave species. We also elucidated the hemicellulose biosynthesis machinery, which will benefit future studies on hemicellulose traits in agave.
650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada AGAVE
650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada FULL-LENGTH TRANSCRIPTOME
650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada GLYCOSYLTRANSFERASE GENE
650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada HEMICELLULOSE BIOSYNTHESIS
650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada LEAF DEVELOPMENT
650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada FUNGUS INFECTION
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Huang, X
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Hu, X.
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Liu, Q.
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Xie, Z.
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Tan, S.
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Qin, X.
700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL
Nombre de persona Yi, K.
856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Identificador Uniforme de Recurso <a href="https://drive.google.com/file/d/1AgVQ-KfeOrlWmzbuKMVtKIFdjb0RMvNP/view?usp=drive_link">https://drive.google.com/file/d/1AgVQ-KfeOrlWmzbuKMVtKIFdjb0RMvNP/view?usp=drive_link</a>
Nota pública Para ver el documento ingresa a Google con tu cuenta: @cicy.edu.mx
942 ## - ELEMENTOS DE ENTRADA SECUNDARIOS (KOHA)
Fuente de la clasificación o esquema de estantería
Tipo de ítem Koha REF1
Holdings
Estatus retirado Estado de pérdida Fuente de la clasificación o esquema de estantería Estado de daño No para préstamo Colección Biblioteca de origen Biblioteca actual Ubicación en estantería Fecha de adquisición Total de préstamos Signatura topográfica completa Visto por última vez Precio de reemplazo Tipo de ítem Koha
            CICY CICY   26/06/2025   B-21772 26/06/2025 26/06/2025 REF1