Genome-wide identification of small interfering RNAs from sRNA libraries constructed from soybean cyst nematode resistant and susceptible cultivars (Record no. 30060)
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| 000 -LEADER | |
|---|---|
| campo de control de longitud fija | 02201nam a2200301Ia 4500 |
| 003 - IDENTIFICADOR DE NÚMERO DE CONTROL | |
| campo de control | MX-MdCICY |
| 005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN | |
| campo de control | 20260521091719.0 |
| 040 ## - FUENTE DE CATALOGACIÓN | |
| Centro/agencia transcriptor | CICY |
| 090 ## - LOCALMENTE ASIGNADO TIPO-LC NÚMERO DE CLASIFICACIÓN (OCLC); NÚMERO DE CLASIFICACIÓN LOCAL (RLIN) | |
| Número de clasificación (OCLC) (R) ; Numero de clasificación, CALL (RLIN) (NR) | B-20016 |
| 008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL | |
| campo de control de longitud fija | 250602s9999 xx |||||s2 |||| ||und|d |
| 245 10 - MENCIÓN DEL TÍTULO | |
| Título | Genome-wide identification of small interfering RNAs from sRNA libraries constructed from soybean cyst nematode resistant and susceptible cultivars |
| 490 0# - MENCIÓN DE SERIE | |
| Designación de volumen o secuencia | Gene, 832, p.146557, 2022 |
| 520 3# - RESUMEN, ETC. | |
| Sumario, etc. | Plant small-RNAs regulate various biological processes by manipulating the expression of target genes at the transcriptional and post-transcriptional levels. However, little is known about the response and the functional roles of sRNAs, particularly small-interfering RNAs (siRNAs), in the soybean-soybean cyst nematode interaction. In this study, siRNA data from 24 sRNA libraries constructed from SCN-infected and non-SCN-infected resistant and susceptible soybean roots were analysed in silico. A total of 26 novel siRNAs including 17 phasiRNAs and 9 nat-siRNAs, as well as two phasiRNAs that were differentially expressed (DE)in three comparisons, were identified. Then, using qRT-PCR, the expression of majority of siRNAs was found to be downregulated after SCN infection, and the expression patterns of DE siRNAs were confirmed. Further functional annotation analyses revealed that the target genes of these siRNA were highly related to disease resistance, which included the genes coding for the NB-ARC domain, leucine-rich repeats, and Hs1pro-1 homologous proteins. Overall, the present research identified novel siRNAs and annotated their target genes, thereby laying the foundation for deciphering the roles of siRNAs in the soybean-SCN interaction. |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | SMALL-INTERFERING RNA |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | SOYBEAN |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | SOYBEAN CYST NEMATODE |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | NAT-SIRNA |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | PHASIRNAS |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Lei, P. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Qi, N. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Yan, J. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Zhu, X. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Liu, X. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Xuan, Y. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Wang, Y. |
| 856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS | |
| Identificador Uniforme de Recurso | <a href="https://drive.google.com/file/d/1csjPJ-Wy6S3v3hbb0yuZCB3-JGujP4Yg/view?usp=drivesdk">https://drive.google.com/file/d/1csjPJ-Wy6S3v3hbb0yuZCB3-JGujP4Yg/view?usp=drivesdk</a> |
| Nota pública | Para ver el documento ingresa a Google con tu cuenta: @cicy.edu.mx |
| 942 ## - ELEMENTOS DE ENTRADA SECUNDARIOS (KOHA) | |
| Fuente de la clasificación o esquema de estantería | |
| Tipo de ítem Koha | REF1 |
| Estatus retirado | Estado de pérdida | Fuente de la clasificación o esquema de estantería | Estado de daño | No para préstamo | Colección | Biblioteca de origen | Biblioteca actual | Ubicación en estantería | Fecha de adquisición | Total de préstamos | Signatura topográfica completa | Visto por última vez | Precio de reemplazo | Tipo de ítem Koha |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CICY | CICY | 25/06/2025 | B-20016 | 25/06/2025 | 25/06/2025 | REF1 |