Towards a Reliable Objective Function for Multiple Sequence Alignments (Record no. 20081)
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| 000 -LEADER | |
|---|---|
| campo de control de longitud fija | 02364nam a2200277Ia 4500 |
| 003 - IDENTIFICADOR DE NÚMERO DE CONTROL | |
| campo de control | MX-MdCICY |
| 005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN | |
| campo de control | 20260521091156.0 |
| 040 ## - FUENTE DE CATALOGACIÓN | |
| Centro/agencia transcriptor | CICY |
| 090 ## - LOCALMENTE ASIGNADO TIPO-LC NÚMERO DE CLASIFICACIÓN (OCLC); NÚMERO DE CLASIFICACIÓN LOCAL (RLIN) | |
| Número de clasificación (OCLC) (R) ; Numero de clasificación, CALL (RLIN) (NR) | B-9898 |
| 008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL | |
| campo de control de longitud fija | 250602s9999 xx |||||s2 |||| ||und|d |
| 245 10 - MENCIÓN DEL TÍTULO | |
| Título | Towards a Reliable Objective Function for Multiple Sequence Alignments |
| 490 0# - MENCIÓN DE SERIE | |
| Designación de volumen o secuencia | Journal of Molecular Biology, 314(4), p.937-951, 2001 |
| 520 3# - RESUMEN, ETC. | |
| Sumario, etc. | Multiple sequence alignment is a fundamental tool in a number of different domains in modern molecular biology, including functional and evolutionary studies of a protein family. Multiple alignments also play an essential role in the new integrated systems for genome annotation and analysis. Thus, the development of new multiple alignment scores and statistics is essential, in the spirit of the work dedicated to the evaluation of pairwise sequence alignments for database searching techniques. We present here norMD, a new objective scoring function for multiple sequence alignments. NorMD combines the advantages of the columnscoring techniques with the sensitivity of methods incorporating residue similarity scores. In addition, norMD incorporates ab initio sequence information, such as the number, length and similarity of the sequences to be aligned. The sensitivity and reliability of the norMD objective function is demonstrated using structural alignments in the SCOP and BAliBASE databases. The norMD scores are then applied to the multiple alignments of the complete sequences (MACS)detected by BlastP with Evalue < 10, for a set of 734 hypothetical proteins encoded by the Vibrio cholerae genome. Unrelated or badly aligned sequences were automatically removed from the MACS, leaving a high-quality multiple alignment which could be reliably exploited in a subsequent functional and/or structural annotation process. After removal of unreliable sequences, 176 (24 |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | BIOINFORMATICS |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | SEQUENCE ALIGNMENT |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | OBJECTIVE FUNCTION |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | ALIGNMENT QUALITY ANALYSIS |
| 650 14 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | GENOME ANALYSIS |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Thompson, J.D. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Plewniak, F. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Ripp, R. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Thierry, J. |
| 700 12 - ENTRADA AGREGADA--NOMBRE PERSONAL | |
| Nombre de persona | Poch, O. |
| 856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS | |
| Identificador Uniforme de Recurso | <a href="https://drive.google.com/file/d/1YAQ5PeRuOyv7w1zSld3O3PW45vq0KttV/view?usp=drivesdk">https://drive.google.com/file/d/1YAQ5PeRuOyv7w1zSld3O3PW45vq0KttV/view?usp=drivesdk</a> |
| Nota pública | Para ver el documento ingresa a Google con tu cuenta: @cicy.edu.mx |
| 942 ## - ELEMENTOS DE ENTRADA SECUNDARIOS (KOHA) | |
| Fuente de la clasificación o esquema de estantería | |
| Tipo de ítem Koha | REF1 |
| Estatus retirado | Estado de pérdida | Fuente de la clasificación o esquema de estantería | Estado de daño | No para préstamo | Colección | Biblioteca de origen | Biblioteca actual | Ubicación en estantería | Fecha de adquisición | Total de préstamos | Signatura topográfica completa | Visto por última vez | Precio de reemplazo | Tipo de ítem Koha |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CICY | CICY | 25/06/2025 | B-9898 | 25/06/2025 | 25/06/2025 | REF1 |